交通工程学院现有：港机类专业、轨道类专业、汽车类专业三大类板块，开设汽车检测与维修、汽车技术服务与营销、港口机械与智能控制、城市轨道交通机电技术、城市轨道交通通信信号技术、新能源汽车检测与维修技术、城市轨道交通车辆应用技术7个专业。其中，港口机械与智能控制专业获全国职业院校交通运输类示范专业点、江苏省高等职业教育高水平骨干专业建设点；拥有省级高职教育实训基地和国家级实训基地；主持完成国家级“港口机械与智能控制”专业教学标准修（制）订工作。
交通工程学院秉承学院“创品牌，走内涵式发展道路”的办学宗旨，近年来取得了各级各类成果和表彰。目前已拥有一支专兼职结合、学历、职称结构合理的师资队伍，师资力量雄厚。现有教授4名，博士（含博士在读）2名，专任教师中40％具有副高以上专业技术职务，90％的中青年教师具有硕士以上学位，60％的教师有企业工作经历，并在相关行业中具有一定影响。拥有全国交通运输系统教学名师1 人、全国交通系统先进工作者1人，交通部专业带头人1人、江苏省交通系统教学名师3人、南通市高校教学名师1人、南通市“226高层次人才培养工程”中青年科学技术带头人3人、南通市科学技术拔尖人才1人、江苏高校“青蓝工程”中青年学术带头人培养对象1人、江苏高校“青蓝工程”优秀骨干教师培养对象3人、江苏省交通运输省级岗位能手1人、江苏省高校“青蓝工程”优秀教学团队1个。
近年来，交通工程学院在专业建设、科研创新、社会服务、大学生技能大赛等方面取得了显著的成绩：主持完成省部级科研课题6项、市厅级课题12项，其中港机专业承担由教育部组织的港口机械与自动控制全国新教学标准研制工作；获得南通市科技进步三等奖1项，南通市自然科学优秀学术论文三等奖1项、中国交通职业教育科学优秀成果奖二等奖1项、三等奖1项；获得江苏省信息化教学比赛一等奖1项，微课大赛一等奖1项、二等奖1项，省交通运输厅说课比赛一等奖1项；获得国家知识产权局授予的国家实用新型专利8项、国家发明专利2项、软权著作权3项等。学生在第十届全国交通运输行业“中联重科杯”筑路工职业技能大赛全国总决赛获得团队第三名的好成绩。
交通工程学院始终按照人才培养目标制定能力培养体系，突出培养学生的实际操作能力和技术创新能力，陆续建成了港机四大综合实训中心，汽车教学实训中心、轨道交通综合实训中心，实验实训固定资产达2000多万元，其中“港口机械与智能控制”专业实训基地为交通运输部及省级高职实训基地。同时学院各专业具有30多个校外实训基地，与连云港港口集团、南京地铁等签署了战略合作协议。以实践课程和实训中心为窗口，交通工程学院还为学生开展装卸机械维修工、港口电器维修工、汽车维修油漆工、汽车检测工、汽车维修工、汽车维修电工、轨道交通信号工等多项高、中级职业资格证书培训和认证资格培训，为学生的能力培养创造了良好的条件。
